Транскриптомика: что изучает и какие задачи решает

Транскриптомика — это направление, которое изучает РНК-транскрипты, отражающие активность генов в клетке или ткани. Проще говоря, транскриптомика помогает увидеть, какие гены включены, насколько активно они работают и как меняется это состояние при болезни, лечении или воздействии внешних факторов.
Где применяется транскриптомика
Она используется в задачах:
- изучение механизмов заболеваний;
- сравнение нормальных и патологических тканей;
- стратификация пациентов;
- оценка ответа на лечение;
- исследования иммунных и воспалительных процессов;
- фармацевтические и биотехнологические проекты.
Почему транскриптомика не заменяет другие omics
Изменение уровня РНК не всегда означает такое же изменение на уровне белков. Между РНК и белком есть дополнительные уровни регуляции. Поэтому транскриптомику часто используют вместе с протеомикой и биоинформатикой.
Что важно для качества результатов
Работа с РНК требует дисциплины:
- качество отбора образца;
- скорость стабилизации материала;
- условия хранения;
- чистота пробоподготовки;
- контроль деградации;
- корректная нормализация данных.
Что нужно лаборатории
В зависимости от платформы обычно требуется базовое оборудование для пробоподготовки, хранение (холод/мороз), центрифуги, расходники для выделения/очистки, мебель и организация чистых зон.
KombiMED помогает лабораториям подбирать оборудование и расходники для молекулярных направлений и сопровождать поставки из Европы с учетом регулярной закупки расходных материалов.