Протеомика часто воспринимается как сложное высокотехнологичное направление, доступное только крупным центрам. На самом деле логика процесса достаточно понятна: в основе лежит последовательная работа с образцом, аналитическим оборудованием и данными. Если каждый этап организован правильно, лаборатория получает воспроизводимый и полезный результат.

Этап 1. Подготовка образца

Это самый важный этап. Ошибки на стадии подготовки почти невозможно исправить дальше. Белки чувствительны к условиям хранения, загрязнениям, температуре и времени. Поэтому уже на старте необходимо контролировать:

Для этой стадии важны не только реактивы, но и базовое оснащение: дозаторы, наконечники, центрифуги, пробирки, холодильное оборудование, морозильные камеры и организованное рабочее место.

• способ отбора образца;
• условия хранения;
• подготовку материала к анализу;
• удаление мешающих веществ;
• стабилизацию белков.

Этап 2. Разделение и фракционирование

После подготовки образца лаборатория должна разделить сложную смесь белков или пептидов. На практике часто используются хроматографические методы. Главная задача — уменьшить сложность смеси и подготовить материал к последующему определению.

Этап 3. Идентификация и количественный анализ

Далее в работу включается масс-спектрометрия, часто в связке с жидкостной хроматографией. Именно здесь лаборатория получает информацию о белках, пептидах, их количестве и ряде структурных особенностей.

Этап 4. Обработка данных

Протеомика не заканчивается на приборе. После аналитической части начинается интерпретация данных: сопоставление с базами, статистика, проверка достоверности, оценка биологического смысла.

Что требуется лаборатории для стабильного workflow

Чтобы протеомный процесс не зависел от случайностей, обычно необходимо предусмотреть:

KombiMED помогает лабораториям подбирать и закупать оборудование и расходные материалы для аналитических и молекулярных проектов, включая организацию поставок и документации.

• стандартизированные SOP;
• качественные расходные материалы;
• продуманную систему хранения;
• надежное аналитическое оборудование;
• сервисную поддержку;
• обучение персонала;
• контроль качества на каждом этапе.